كان محمد حسان من المشايخ الذين يرفضون الخروج على الحُــكام ويرفضون الحديث في السياسية قبل ثورة يناير، ويُـــرجِع البعض ظهور القنوات الفضائية الإسلامية إلى العلاقة المتينة التى كانت تربطه بالأجهزة الأمنية في عهد الرئيس الأسبق محمد حسني مبارك ووزير الداخليته حبيب العادلى .

ومع بداية ثورة يناير واستمرار الاعتصام بميدان التحرير ظهر الشيخ محمد حسان يوم 4 فبراير قبل التنحي في ميدان التحرير مطالبا الشباب بعدم التصعيد والحفاظ على الأرواح والممتلكات والعودة بحجة حقن الدماء في هذه الفتنة بل إنه طالب في أحد البرامج الفضائية المعتصمين في التحرير للعودة إلى بيوتهم وإعطاء مبارك فرصة حقنا للدماء.

ووصِــف محمد حسان في عهد المجلس العسكري بأنه كان من أكثر المدافعين عن الجيش بل وله خطبة شهيرة من على جبل عرفات يحذر فيها من كسر الجيش، وأنه الأمل الباقي للشعب والحصن الأخير، واستعان به قيادات المجلس العسكري في العديد من المناسبات فزادت شعبيته عند البعض وهاجمه الثوار فى ذلك التوقيت .

وبعد فوز مرشح الإخوان المسلمين في الرئاسة الدكتور محمد مرسي قل ظهور حسان على المستوى السياسي؛ خوفا من انتقاد الرئيس المعزول حيث ارتبط حسان بعلاقات قوية مع جماعة الإخوان المسلمين بعد احداث يناير وخاصةً مع بوادر صعود تيار الإخوان المسلمين للحكم  ,  وعمل الإخوان على استقطاب حسان إليهم في العديد من المليونيات والمؤتمرات بل إن خيرت الشاطر طلب منه الانضمام للهيئة الشرعية للحقوق والإصلاح كنائب للهيئة بحجة تجميع مختلف التيارات الإسلامية تحت راية الهيئة.

ووافق حسان فكان نائبا للهيئة بالإضافة إلى كونه عضوا لمجلس شورى العلماء السلفي، والذي شكل أيضا بعد ثورة يناير لكن مع استمرار الهجوم على مرسي وانشغال جماعة الإخوان المسلمين بأخونة الدولة والهيمنة على مفاصل الدولة الكبرى  وعدم الالتفات للنصائح ظهر الشيخ محمد حسان مهاجما للجماعة في الكثير من الخطب والمحاضرات .

كان أبرزها في خطبة له بمسجد عمرو بن العاص طالبهم فيها بعدم الإقصاء وإشراك جميع القوى السياسية بل عرض مبادرة على جبهة الإنقاذ بالتدخل للصلح والحوار بين الرئاسة والإخوان وجبهة الإنقاذ لكنه قوبل بوابل من السباب والشتائم من جماعة الإخوان المسلمين وشبابها على شبكات التواصل الاجتماعي،.

فاختفى قليلا عن المشهد إلى أن بدأت الدعوات لـ 30 يونيو، وكان حسان من الرافضين لخطاب منصة رابعةالعدوية , وحاول كثيرا التوصل لإنهاء الاعتصام بدلا من فضه بالقوة وعرض مبادرة للصلح بين القوات المسلحة والإخوان لفض رابعة لكن الإخوان رفضوا إلى أن تم فض الاعتصام بالقوة صبيحة يوم الاربعاء الموافق الرابع عشر من اغسطس لهذا العام .

وظهر حسان أخيرا في ميدان مصطفى محمود بعد ساعات من فض رابعة العدوية ونضهة مصر مطالباً بحقن الدماء وهاجمه البعض من انصار التيار الاسلامى ابرزهم الإخوان المسلمين ، قائلين له: أين كنت عندما قتلنا في أحداث المنصة والحرس الجمهوري؟ لكنه لم يكمل وأصيب بإغمائة وتم نقله إلى المستشفى ومن وقتها وهو لم يظهر وجهاً لوجه للجمهور .

ثم قام  محمد حسان بالتعليق على المواقف السياسية الطفيفة من خلال تسجيلات صوتية يبثها موقع قناته " الرحمة الفضائية " على الانترنت , آخرها الحكم الصادر بحق فتيات الأسكندرية .